Research & Development, CTO & Co-FounderCarsten Krumbiegel
Carsten Krumbiegel leitet das Science Team von BIOMES, ist CTO und Mitgründer von BIOMES. Er ist spezialisiert auf Bioinformatik und Biosystemtechnik. Nach seiner Laufbahn als akademischer Mitarbeiter an der TH Wildau leitete er das Sequencing Team der
Ibiomics GmbH.
Casten Krumbiegel erlernte zunächst einen Ausbildungsberuf, bevor er seine wissenschaftliche Karriere antritt. Nach seinem erfolgreichen Abschluss des Studiums Bioinformatik und Biosystemtechnik im Bachelor und Master begann er eine akademische Karriere an der TH Wildau. Er etablierte unteranderem Hochdurchsatzsequenzierungen zur
humangenetischen Diagnostik und koordiniert und plant weitere Forschungsprojekten im Bereich der Bioinformatik. Daraufhin tritt er die Stelle des Abteilungsleiters der Sequencing bei
Ibiomics GmbH an und baut ein NGS-WetLab inkl. IT-Anbindung auf und koordiniert die wissenschaftliche Produktentwicklung.
2017 begann er seine unternehmerische Karriere als Mitgründer bei BIOMES und leitet nun das Bioinfomatik als auch Forschungs- und Entwicklungsteam bei BIOMES.
Berufliche Erfahrung
| 2017 | CTO & Co-Founder der BIOMES NGS GmbH |
| 2014-2016 | Abteilungsleiter Sequencing, Ibiomics GmbH, |
| 2010 – 2014 | Akademischer Mitarbeiter, Technische Hochschule Wildau |
| 2008 – 2010 | Master of Science (M.Sc.) TH Wildau, Master-Studiengang Biosystemtechnik / Bioinformatik; Master Thesis: „Hochdurchsatzverfahren zur Parameterinversion eines systembiologischen Differentialgleichungssystems der humanen Thrombinkaskade“ |
| 2005 – 2008 | Bachelor of Science (B.Sc.) TH Wildau, Bachelor-Studiengang Biosystemtechnik / Bioinformatik; Bachelor Thesis: „Expectation-Maximization-Schätzung von Mischverteilungen für die Elektronen-Spin-Resonanz-Analyse von Albumin“ |
Publikationen
Franke P, Krumbiegel C, Girke B, Hammer P, Frohme M, Debebe T. Diet Type, Antibiotic Intake and Gut Microbiota: A Lesson from a Large Cross-Sectional Study. Archive of the International Society of Microbiota, 2019 (pp 1-112).
Angers-Loustau, A., Petrillo, M., Bengtsson-Palme, J., Berendonk, T., Blais, B., Chan, K. G., Coque, T. M., Hammer, P., Heß, S., Kagkli, D. M., Krumbiegel, C., Lanza, V. F., Madec, J. Y., Naas, T., O’Grady, J., Paracchini, V., Rossen, J. W. A., Ruppé, E., Vamathevan, J., . . . Van den Eede, G. (2018). The challenges of designing a benchmark strategy for bioinformatics pipelines in the identification of antimicrobial resistance determinants using next generation sequencing technologies. F1000Res, 7. https://doi.org/10.12688/f1000research.14509.2
Siptroth, J., Moskalenko, O., Krumbiegel, C., Ackermann, J., Koch, I., & Pospisil, H. (2023). Variation of butyrate production in the gut microbiome in type 2 diabetes patients. Int Microbiol. https://doi.org/10.1007/s10123-023-00324-6
Siptroth, J., Moskalenko, O., Krumbiegel, C., Ackermann, J., Koch, I., & Pospisil, H. (2023). Investigation of metabolic pathways from gut microbiome analyses regarding type 2 diabetes mellitus using artificial neural networks. Discover Artificial Intelligence, 3(1), 19. https://doi.org/10.1007/s44163-023-00064-6
